Pilihan Kelas
Tahfidzul Qur'an
Dalam 3 tahun pembelajaran Tahfidzul Qur’an di MTs. Darun Najah, siswa diarahkan dan ditargetkan mampu menghafal 15 juz. 15 setelahnya dilanjutkan di MA Darun Najah.
Agama/Kitab
Pembelajaran dengan fokus pengembangan Nahwu Shorof, Bahasa Arab, serta kitab Hadist, Fiqih, serta Tafsir yang mendalam.
Sains/IPA
Pembelajaran menyenangkan dengan metode pengembangan sains terbaru. Fokus pada materi IPA & matematika dengan praktek dengan tujuan mengembangkan siswa untuk menjadi ilmuwan.
Reguler/Umum
Kelas Reguler merupakan kelas umum yang pengembangannya pada pemerataan semua pembelajaran. Tidak terkhusus pada mata pelajaran tertentu. Lebih difokuskan pada pengembangan non-akademik seperti keterampilan dan juga olahraga.